Systemweite Installation¶

Wenn Chimera systemweit für alle Benutzer installiert werden soll, dann muss der Installationsassistent mit administrativen Rechten ^[3] gestartet werden: ^[1]

sudo ./chimera-VERSIONSNUMMER-linux-ARCH.bin 

Während des Installationsvorgangs werden einige Konfigurationsmöglichkeiten angeboten (hier jeweils mit Standardkonfiguration):

Enter install location: /opt/UCFS/ChimeraARCH-VERSION

Die Standardkonfiguration des Installationsverzeichnisses ist empfehlenswert oder es sollte ebenfalls ein Verzeichnis in /opt sein - ⏎

Install desktop menu (icon has to be done by user)? yes

Installiert bei Bedarf den Programmstarter /usr/share/applications/UCSF-ChimeraARCH-VERSION.desktop für einen Menüeintrag und das Programmicon /usr/share/icons/hicolor/48x48/apps/UCSF-Chimera.png - ⏎

Install symbolic link to chimera executable for commandline use in which directory?
0 -- no link
2 -- /usr/local/bin

Setzt bei Bedarf eine symbolischen Verknüpfung der ausführbaren Datei in ein Verzeichnis, das in PATH hinterlegt ist. Damit kann man das Programm im Terminal ^[1] ohne Pfadangabe ausführen - 0 , 1 , 2 usw.

Empfohlen wird dafür /usr/local/bin.

Create unversioned link to chimera executable in the same directory? yes

Standardmäßig wird die symbolische Verknüpfung der ausführbaren Datei auf chimera-VERSION gesetzt. Hiermit kann zusätzlich eine unversionierte Verknüfung auf chimera eingerichtet werden - ⏎

Installation is done; press return.

Wenn die Installation erfolgreich durchgelaufen ist, kann der Installationsassistent durch erneutes Drücken der Taste ⏎ beendet werden.

Installation im Homeverzeichnis (empfohlen)¶

Chimera kann direkt im Homeverzeichnis eines Benutzers installiert werden, was insbesondere für Einzelbenutzersysteme sehr zu empfehlen ist. Dafür kann der Installationsassistent ohne zusätzliche administrative Rechte gestartet werden: ^[1]

./chimera-VERSIONSNUMMER-linux-ARCH.bin 

Während des Installationsvorgangs werden einige Konfigurationsmöglichkeiten angeboten (hier jeweils mit Standardkonfiguration):

Enter install location: ~/.local/UCFS-ChimeraARCH-VERSION

Die Standardkonfiguration des Installationsverzeichnisses gibt ein verstecktes Verzeichnis vor und man sollte stattdessen ein anderes Verzeichnis verwenden; bspw. ~/Anwendungen/chimera-VERSION/ - ⏎

Install desktop menu and icon? yes

Installiert bei Bedarf den Programmstarter ~/.local/share/applications/UCSF-ChimeraARCH-VERSION.desktop für einen Menüeintrag, eine Desktopverknüpfung und das Programmicon ~/.local/share/icons/hicolor/48x48/apps/UCSF-Chimera.png - ⏎

Install symbolic link to chimera executable for commandline use in which directory?
0 -- no link
1 -- /home/BENUTZER/bin

Setzt bei Bedarf eine symbolischen Verknüpfung der ausführbaren Datei in ein Verzeichnis, das in PATH hinterlegt ist. Damit kann man das Programm im Terminal ^[1] ohne Pfadangabe ausführen - 0 , 1 usw.

Im Homeverzeichnis sollte dafür das Verzeichnis ~/bin angelegt werden. Das Verzeichnis muss bereits existieren, weil der Installationsassistent die Verknüpfung sonst nicht setzen kann. Das kann vor der Bestätigung dieses Installationsschritts noch nachgeholt werden.

Create unversioned link to chimera executable in the same directory? yes

Standardmäßig wird die symbolische Verknüpfung der ausführbaren Datei auf chimera-VERSION gesetzt. Hiermit kann zusätzlich eine unversionierte Verknüfung für chimera eingerichtet werden - ⏎

Installation is done; press return.

Wenn die Installation erfolgreich durchgelaufen ist, kann der Installationsassistent durch erneutes Drücken der Taste ⏎ beendet werden.

Programmstart¶

Sofern bei der Installation der notwendige Programmstarter angelegt wurde, kann Chimera über ein Anwendungsmenü unter dem Menüpunkt "UCSF Chimäre VERSION" aufgerufen werden. Bei der Installation ins Homeverzeichnis steht zusätzlich eine Desktopverknüpfung zur Verfügung.

Wurde die symbolische Verknüpfung gesetzt, kann das Programm ohne zusätzliche Pfadangabe im Terminal gestartet werden: ^[1]

chimera-VERSION 

Oder über die unversionierte Verknüpfung:

chimera 

Hat man bei der Installation weder den Programmstarter noch die Verknüpfungen einrichten lassen, kann das Programm aus dem Installationsverzeichnis heraus aufgerufen werden: ^[1]

/opt/UCSF/ChimeraARCH-VERSION/bin/chimera
~/Anwendungen/chimera-VERSION/bin/chimera 

Deinstallation¶

Da Chimera mit dem Installationsassistenten an der Paketverwaltung vorbei installiert wird, ist für die Deinstallation etwas Handarbeit notwendig.

Im Installationsverzeichnis findet sich ein Deinstallationsskript, das allerdings nicht alle Dateien entfernt. Als Beispiel werden hier die empfohlenen Pfade aus der Installation verwendet.

Systemweite Deinstallation:

sudo /opt/UCFS/ChimeraARCH-VERSION/bin/uninstall
sudo rm -r /opt/UCFS
sudo rm /usr/local/bin/chimera /usr/local/bin/chimera-VERSION
sudo rm /usr/share/icons/hicolor/48x48/apps/UCSF-Chimera.png 

Deinstallation aus dem Homeverzeichnis:

~/Anwendungen/chimera-VERSION/bin/uninstall
rm ~/bin/chimera ~/bin/chimera-VERSION
rm ~/.local/share/icons/hicolor/48x48/apps/UCSF-Chimera.png